各学年3クラスで合計12人の生徒会役員の中から、選挙で生徒会長と副会長を選出。週1回のミドルステージ・マリアンホール朝礼の司会、生徒会朝礼の企画、サレジオの創立者を記念するドン・ボスコフェスティバルの企画などを主に行っています。6月に開催されるサレジオ祭では、ドン・ボスコ委員と一緒にドン・ボスコ社の商品と、マラウイの給食支援につながるフェアトレードのコーヒーなどを販売。自分たちの活動が誰かの役に立つ、という実感を得る機会となっています。
ミドル生から自作の句を募集する俳句川柳大会も生徒会の企画です。